在渔业生产中，引起水产经济动物发病的原因很多，单纯检查患病动物机体不一定能查出真正的病因，还必须结合现场调查进行综合分析判断。
发病情况调查
１、现场观察水产经济动物出现的各种异常现象。水产经济动物发病时，不仅在体表、体内出现各种症状，还会有离群独游、摄食量急剧下降等现象出现。水产经济动物发病分急性和慢性两类，急性型患病动物整体看起来外观和体质与正常动物差别不大，仅病变部位稍有变化，死亡率急剧上升；慢性型患病动物则往往会出现体质消瘦、活动缓慢、体色发黑、离群独游的现象，死亡率缓慢上升。如当鱼虱侵袭时，鱼的体色等变化不大，但常上跳下窜，阵性狂游；当鲢碘泡虫侵袭白鲢时，鲢鱼尾部上翘，露出水面，在水中狂游乱窜打圈子。因农药或工业污水排放而造成鱼类中毒时，鱼会出现跳跃和冲撞现象，一般在较短时间内就转入麻痹状态甚至死亡。因此，及时到现场观察鱼的活动情况对于鱼病的及时诊断和处理具有重要意义。
２、调查发病情况。要调查清楚什么时候开始发病；在一个鱼池中是否只有一种鱼发病，还是几种鱼同时发病；发病鱼在行动上有何异常表现；发病鱼死亡情况；曾经采取的治疗方法等。如养殖动物生长、摄食正常，但天气不闷热，晚上也不浮头，但一夜之间全池鱼或大部分鱼死亡，应首先怀疑为中毒；天气闷热，鱼塘中养殖鱼类黎明前开始浮头，清晨大量死亡，可初诊为泛池；下塘后１０—１５天的青鱼、草鱼鱼苗成群结队绕池边狂游，可初诊为跑马病或车轮虫病。
水质与环境调查
包括了解水源中有无污染源、养殖池及池水的消毒情况、水温的变化情况、水质情况、鱼池周围农田施药情况、鱼池底质情况、是否漏水、鱼池的大小及深鱼池中是否有作为某种鱼类寄生虫的中间寄主、周围是否有作为某种鱼类寄生虫的终末寄主等。
各种病原体都有其繁殖生长的最适温度范围，一般在平均水温２５℃左右时，毒力显著增强；水温２５—３０℃时，病毒和细菌感染性最强，易形成细菌病、病毒病的流行高峰；水温降到２０℃以下时，则毒力减弱，病情也相应减弱或停止。小瓜虫生长和繁殖水温一般在１５—２５℃，当水温低于１０℃或高于２６℃时，则停止发育。斜管虫在水温１２—１８℃时大量繁殖。
观察水的颜色，可以大致了解水质情况。如水呈褐色说明腐殖质较多；水中含钙质多时呈天蓝色；呈铜绿色说明微囊藻大量繁殖；城市排出的生活污水一般呈黑色。水中的溶解氧、ｐＨ值、硫化物、氯化物等与鱼病流行的关系极为密切，现场调查时可用水质快速检测盒等仪器进行检测。如目前网箱养殖鱼类在寒冷的冬季常大批死亡，多数是因水温高于气温，底层水温高于表层水温，水体上下对流造成鱼类缺氧所致，一般现场测定水中溶氧可基本确诊。如测出水源中重金属离子、硫化氢等超标，则估计引起水产经济动物中毒死亡的可能性较大；如测出水中氯化物含量高、硬度大，则估计小三毛金藻的大量繁殖对造成鱼类中毒死亡的可能性较大。有机质多而水质发臭，则容易引起鳃霉病的流行；酸性水则常引起嗜酸卵甲藻病的暴发；养殖池不进行彻底消毒，流行过的鱼病还会发生；鱼池漏水，鱼苗易患跑马病；双穴吸虫病流行地区的鱼池中一定有第一中间寄主锥实螺，周围有终未寄主红嘴鸥。特别是对一些急剧大量死鱼的现象，若确诊为中毒死亡，应迅速了解施药的种类或污水中的主要致死化学成分，并采取应急措施，予以补救。如农药五氯酚钠引起塘鱼中毒死亡时，可将中毒的鱼及时转入未被污染的鱼池，或全池遍洒生石灰，使池水呈３０—３７ｐｐｍ的浓度，可使中毒程度得到缓解。
饲养管理调查
主要调查清楚以前的清塘方法，养殖水产经济动物的种类、来源、密度，鱼放养前是否经过消毒及用何种药物消毒，投喂饲料的种类、数量和质量，施肥的种类和数量等。如鱼池未用药物进行彻底清塘，那么去年发生过的鱼病，今年就很可能再度暴发；投喂酸败饲料和腐烂变质饲料，鱼就较易患肠炎病、食物中毒或瘦背病而死亡；放养密度过大，养殖动物一方面因摄食不足、生长不良而导致抗病力降低，另一方面因个体间接触机会增加，有助于疾病的传播和暴发；在池中直接沤肥，施肥量过大，投饵量过多等，易使池水恶化，形成缺氧，影响鱼的生长，同时给病原体和水蜈蚣等敌害生物创造了生长条件，引起大批鱼死亡；水质过瘦，饵料生物缺乏，又容易引发跑马病、萎瘪病；拉网等操作造成鱼体损伤，容易引发白皮病和肤霉病；鱼从外地运来，且未对鱼进行抽样检查及鱼体消毒，就很有可能把外地的流行病带入本地。
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