大水面养殖一般指在水库、湖泊、溪河及大型塘堰内养鱼，它具有面积大、水位深、水容量大的特点，同时兼有蓄洪和灌溉功能。该水面防治鱼病常用遍洒给药法施药，用量大、成本高，且药物流失快，鱼病难以控制和治疗。所以，要采用不同于一般池塘养鱼的防治措施及办法。
一、冬放健壮的大规格鱼种
大规格鱼种具有抗敌害能力强、抗病性强、成活率高的特点。一般要求青、草鱼为2龄鱼种，尾重在250克以上；鲤、团头鲂尾重50克以上；鲢、鳙尾重100克以上。冬季比春季水温低，鱼鳞片紧密，活动能力弱，冬放鱼种可减少操作过程中的鱼体受伤，使之不易受病原生物的侵袭，有利于预防鱼病。
二、鱼种严格消毒
鱼种放入水中之前，集中在容器或较小的池塘中，用药浸洗消毒，杀灭体表的病原生物。如水温在15℃～20℃，则用3%的食盐水浸洗鱼体10分钟～15分钟，或用8微升／升水的硫酸铜液浸洗20分钟～30分钟，可防寄生性鳃病。每立方米水用0.13毫升～0.15毫升“灭虫灵”浸洗5分钟～10分钟，可防中华鳋、锚头鳋、鱼鲺和指环虫病；10微升／升水的漂白粉液或1微升／升水“杀菌王”液浸洗20分钟～30分钟，可防细菌性鳃病以及皮肤病。
三、免疫预防
草鱼鱼种放养前，将出血灭活疫苗稀释10倍后，每尾注射0.2毫升～0.5毫升，可保障14个月内不发生病毒性出血病，同时对草鱼烂鳃、赤皮、肠炎等病亦有一定的预防作用。还可以给鱼种注射细菌疫苗，预防相应的细菌性疾病。
四、投喂药饵
在发病季节或发现有鱼开始死亡时，立即对症用有效药物拌饵投喂。如用“鱼家乐—A”内服，可防治草鱼肠炎、赤皮病等。
五、定期消毒食场
大水面养鱼应在静水区设几个固定的投食区，定时定位投饵，使鱼形成每天准时到固定地点吃食的习惯。在投食前食场用“杀菌王”、漂白粉或生石灰泼洒，可使鱼在吃食时置身于药水中，可杀灭体表病原体，用这种方法防病可大大节省用药量。
六、切断疾病的传播途径
由复殖吸虫引起的鱼病很难治疗，主要靠预防。由于这些寄生虫有特定的生活史，它们以椎实螺、鱼、鸥鸟为中间或终身宿主，只要切断其生活史，病原体就难以生存。方法是将稻草捆成把，插入水体下风处，每天早晨取出草把，把附在草上的椎实螺抖下来晒死，连续几天，基本上可以清除水体中的椎实螺，同时注意驱赶鸥鸟，可控制此病。
