大菱鲆养殖进入秋末后至第二年春，易发生淋巴囊肿和盾纤毛虫两种疾病，此二病发病适温均为10－20℃，尤其在15℃左右，因此要做好淋巴囊肿和盾纤毛虫两病的防控。
1． 淋巴囊肿病（LD）
由鱼淋巴囊肿病毒引起。
病症：病鱼的体表、鳍、尾部等处出现许多小泡状囊肿物，类似乳头状肿瘤，有的紧密相连，成桑椹状；病灶呈白色、淡灰色、灰黄色，有的带有出血灶而显微红色；严重患者可遍及全身，包括内脏组织器官。高密度养殖感染率可达90％。主要危害1龄鱼。本病单纯感染病鱼一般不会致死，但外表难看，会失去商品价值。
2. 盾纤毛虫病（嗜腐虫病）
常见的病原有海洋尾丝虫和指状拟舟虫等。
病症：主要危害幼鱼，死亡率高达80％以上。受感染的幼鱼不能顺利转为底栖而上浮独游，食欲不振或不摄食，体色变黑，粘液增多；一些严重感染的鱼体体表、鳍、鳃盖内侧发红出血，有的溃烂。镜检病灶组织或解剖濒死病鱼鳞囊内甚至脑颅内可看到运动活泼的虫体。
3．两种病的防治方法：
（1） 发病池和鱼（含使用工具）均应严格隔离。
（2） 谨慎操作避免鱼体受伤。
（3） 有条件者可以升温（22－24℃）养殖。
（4） 对于感染淋巴囊肿病的病鱼，可用50ppm3%的双氧水药浴1－2小时，再升温养殖（22－24℃），10天左右可愈；盾纤毛虫病，定期（10－15天）用淡水浸泡15－20分钟，或用150ppm的福尔马林药浴1.5－2小时/天，连续药浴3－4天。
