养殖牙鲆对水质要求较高，一旦发病则会迅速蔓延。养殖牙鲆的病害防治应以防为主，治疗为辅。
一、弹状病毒病
由牙鲆弹状病毒（HRV）感染引起。病鱼体表和鳍部充血，腹部膨大且内有腹水，肌肉、鳍基部可见点状出血，生殖腺淤血，脑出血。鱼体发病时，水温一般都在15℃以下。幼苗期和仔鱼期的鱼体易患此病。
平时要保持水温、水体盐度的稳定，不选用毒性大、刺激性强的药物；定期使用碘康2-3克/立方米药浴，每次不超过2小时；经常在饲料中添加高稳VC2-3克/千克及中药四黄粉5-6克/千克，以增强牙鲆的抗病毒能力。疾病发生后，全池泼洒碘康3-5克/立方米消毒水体3小时，每天1次，连续2-3天；或用服来康1克／立方米药浴1.5小时。同时，将水温升至15℃以上，鱼病可逐渐自愈。
二、溶血性腹水病
由爱德华氏菌或嗜水气单胞菌感染引起。患病鱼体腹部膨胀且内有大量腹水，多数患病鱼体的直肠脱垂于肛门外，体色发黑，鱼体在水中急速旋转、上下翻滚若干小时后，腹部朝上漂于水面，直至死亡。有的病鱼眼球外突，角膜白浊，消化道内无食物且色淡；也有的病鱼内脏溃疡，肝局部坏死、出血，肾肥大，鳍发红。主要流行于夏季水温高温期的7-8月间，一般水温在25℃以上。从仔鱼期到成鱼期的鱼体均有发生。
目前，还没有较有效的药物加以治疗，平时尽量保持水质清新。常用含溴或含碘消毒剂药浴(每次不超过2小时)，发病季节定期在每公斤饲料中添加鱼血安3克、海水鱼多维5克。疾病发生后，全池泼洒土霉素7克/立方米，保持2-3小时，每天1次，连续2-3天；也可以全池泼洒二溴海因0.3克/立方米药浴，每次不超过2小时。同时，在饲料中添加中药四黄粉3-5克/千克及高稳VC2-3克/千克，连续投喂5-7天为一个疗程。或用二溴海因0.2克 服来康0.5-1克／立方米药浴1.5小时，每天2-3次，同时每公斤饲料中添加鱼血安2-3克 肝泰2-4克 海水鱼多维7克，直到症状消失。
三、链球菌病
主要是β溶血性链球菌。患病鱼体的外观病症不如其他症状明显。病鱼眼球白浊、充血、突出，鳃盖发红，上下腭充血，肠道发红，腹腔内有积水，肝脏出血等。水温高温期易发生此病，主要危害仔鱼。
平时尽量保持水质清新，避免过量投喂，并及时清除残饵，以改善水质；常用含溴消毒剂药浴鱼体，每次不超过2小时，发病季节则定期在饲料中添加土霉素1-2克/千克进行内服；疾病发生后，全池泼洒二溴海因或二氧化氯0.3克/立方米 服来康0.5克／立方米药浴，保持2小时后换水，每天2次。同时，在饲料中添加肠鳃灵2-3克/千克和中药四黄粉5克/千克，连续投喂5-10天为一个疗程。
四、传染性肠道白浊症
病原主要是弧菌属细菌。患病鱼体不摄食，并在养殖池侧壁或角落处聚集成群，活动呆滞。解剖后可见病鱼肠道发白，腹部膨大，消化道内存有大量饲料。随着病情的发展，鱼体腹部下陷后死亡，且鱼体发病后蔓延快，死亡率高。多发生于变态前期的仔鱼。
此病重在加强平时的预防工作，保持良好的饲育环境和合理的放养密度；加强前期基础饵料生物的营养强化，要求投喂使用油脂酵母及小球藻培育的轮虫等优良饵料。
五、盾纤毛虫病
病原是盾纤毛虫。患病鱼体摄食不良，体色黑化，常在水体上层缓缓游动。严重感染时，盾纤毛虫寄生处粘液增多，体表和鳍发红糜烂，有时伴有头部发红、鳃部出血、鳃盖内侧发红等症状。盾纤毛虫主要寄生于鱼体体表和鳃部，严重时侵入皮下组织，并随血液游走于心脏、大脑等器官，造成致命的损伤，死亡率较高。多发生于春末夏初，水温20℃以下，是牙鲆育苗过程和仔鱼期的常见病害，特别是在鱼苗着地变态时的危害甚大。
发病季节定期用鱼虫克星0.5克／立方米药浴1.5小时，每周1次。养殖过程中不投喂冰鲜饵料，要喂配合饲料，以防止嗜腐虫类被带入养殖池；每隔10天对水源进行1次消毒；疾病发生后，可用福尔马林100克/立方米，或鱼虫克星0.5-1克 福尔马林200-300克／立方米药浴1.5小时，同时提高水温至20℃以上，每天2次，连续3-4天，然后用二溴海因0.2克/立方米药浴1小时，以巩固疗效。
六、隐核虫病
主要由刺激隐核虫（又名海水小瓜虫）感染引起。患病鱼体摄食降低，体色变黑，常在水面游动。海水小瓜虫主要寄生于鱼体鳃部和体表上，寄生部位粘液增多，甚至引起组织损伤，并造成继发性细菌感染。一年四季均可发生。
养成良好习惯，密切注意观察鱼的活动状况，有异常则镜检，以便及时发现。定期用鱼虫克星0.5克／立方米药浴1.5小时，每半月1次；治疗用鱼虫克星0.5-1克 福尔马林200-300克／立方米药浴1.5小时，每天2-3次，连续3-4天。
七、车轮虫病
主要由车轮虫寄生感染引起。车轮虫主要寄生于牙鲆体表上，患病鱼体的体表变黑，体表粘液增多，鱼体在水面游动。取病鱼鳃组织、体表粘液镜检，可发现形似车轮的虫体。虫体运动、刺激而造成鱼体组织损伤，并易继发细菌感染。一年四季均可发生，但以6-10月水温高温期发生最多。
密切注意观察鱼的活动状况，有异常则镜检，以便及时发现。在6-10月高水温期，每半月用鱼虫克星0.5克／立方米药浴1.5小时一次；虫体寄生鱼体后，用鱼虫克星0.5-1克 福尔马林150-200克／立方米药浴1.5小时，每天2次，连续2-3天。值得注意的是，进行药浴过程中循环水已停止，牙鲆鱼对水质要求较高又不耐低氧，需加大充气量且每次最好不要超过2小时。
八、营养性疾病
饲料中脂肪氧化生成过氧化物，鱼体连续摄食后引起肝脏代谢障碍所致。患病鱼体体色黑化，鱼体消瘦、行动缓慢、食欲不振，经检查无寄生虫寄生和细菌性疾病后，可确定为营养性疾病。
日常避免使用腐败变质或新鲜度较差的饲料；使用脂肪含量高的饲料要特别注意保鲜，而投喂冰冻饵料时要注意解冻水洗后再投喂；平时在投喂的饲料中可多添加一些高稳VC和氯化胆碱，以防止饲料中的脂肪被氧化。
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