所谓健康养殖就是根据养殖鱼类正常活动、生长、繁殖所需的生理、生态要求，也就是按照养殖鱼类的生态习性和鱼池生态环境的特点，选择科学的养殖模式，调整养殖结构，合理放养密度，利用生态学原理预防鱼病的发生，将健壮的养殖品种通过系统的规范管理技术，使其在人为控制的环境中健康快速生长。
一、 改善水体生态环境
改善水体的生态环境包括改善池塘的底质和水质两个方面。
1、 改善池塘的底质：
首先要清除池底淤泥，因为它是水体中的主要耗氧源，又是病原体的滋生和藏身之处，大量的有机物质在缺氧的条件下产生氨或胺及硫化氢等有害物质，直接或间接地引起鱼类发病或死亡，从而影响产量和效益。因此，在冬季或早春要将池水排干，让池底冰冻日晒，杀死病原菌。挖去过多淤泥，修补堤埂，填好漏洞，整平池底。放养前10—15天用生石灰100—150KG/亩进行干法清塘，以杀灭病原体和敌害生物。清塘4天后加水至1米深左右，加水6天后即可放鱼种。进水时要用细纱窗严格过滤，以防野杂鱼混入。
2、 改善水体的水质：
首先要选择水源充足无污染的地方，同时清理改造进排水設备，做到进排分开，为了保持水质的肥、活、嫩、爽，要科学调节水质，如开增氧机，经常换水，特别是鱼类生长旺季，每15—20天要换水一次，每次换水量在20—30厘米，以保持水质清新，从5月下旬至9月，每月泼洒生石灰一次，每亩施生石灰15公斤，起到调节水质和消毒的作用。
二、 调整养殖结构和放养密度
我国池塘养鱼的主要特点是多品种、多规格混养、轮养，因此，可以利用杂食性鱼（如罗非鱼、鲫鱼等）消除残饵的功能，肥水性鱼（如鲢、鳙鱼）净化水质的功能，调整吃食鱼、杂食鱼、肥水鱼的品种和比例，自然净化水质达到健康生态养殖的目的。
由于对养殖品种的营养生理及代谢的基础研究不足，在高密度养殖条件下，用高营养饲料及过量投喂，导致养殖水体富营养化，带来毁灭性暴发病蔓延和整个水域的环境污染。因此，放养密度应根据设计产量、出池规格、饲养技术来确定，科学合理混养和密养。不可随意增加放养密度，破坏养殖水体的生态平衡。
三、改进养殖鱼的饲养管理
1、 饲料的选择
选择高质量的饲料可以使鱼类保持良好的健康状况，最佳的生长和产量，并尽可能减少给环境带来的污染。养殖使用的饲料卫生指标及限量应符合水产行业标准《无公害食品 鱼用饲料安全限量（SC 1052—2001）》的规定。
2、 合理投喂
依据水温确定投饲率，并制定月计划投饵量，视天气、水质和鱼吃食的情况适当掌握，每次投喂最好达到鱼类饱食量的90%。投喂坚持“四定”原则，每天投喂一般2—4次不等，做到少量多次。
在坚持“四定”原则的基础上，还应根据鱼类营养要求和摄食规律，积极推广配合饲料，青、精、粗相结合，在投饲方式上实行“两头精，中间青”的原则。
3、 合理施肥
改进施肥技术，在按常规做到“四看”、适时、少施、勤施的同时，根据水温和水质变化规律，结合鱼类对水质的要求，以有基肥为基肥，春秋两季追施有机肥和无机肥，夏季少施分散肥，并以无机肥为主，保持水质“肥、活、嫩、爽”。
4、 加强日常管理
坚持每日早、中、晚巡塘，及时清除残饵、杂物及死鱼等，确保池塘及周围环境的卫生。观察水温及水质变化，检查鱼类摄食情况，灵活掌握饲料投喂量，做好记录，定期进行总结。发现危险信号及时采取措施，避免造成损失。
四、利用生态环境防治鱼病
池塘健康养殖常规鱼过程中对病、虫、敌害生物的防治，坚持“全面预防，积极治疗”的方针，强调“防重于治，防治结合”的原则，提倡生态综合防治和使用生物制剂、中草药对病虫害进行防治。
首先做好池底淤泥的清除和消毒工作，使得病原体没有滋生和藏身之处。其次要把好鱼种关，选择均匀整齐，体质健壮，健康无病的鱼种，放养的鱼种在入池前必须进行消毒，用15PPM的高锰酸钾药浴20分钟或用3%食盐水药浴15分钟，可防治细菌性烂鳃病、白头白嘴病、打印病、车轮虫病等。再次，科学调节水质，增加水中溶氧，保持水质清新，除开增氧机，定期注、排水和用生石灰调节水质外，在6—9月份，每月全池泼洒一次低毒高效杀虫药物，隔一天再全池泼洒氯制剂等杀菌药物，同时坚持内服药饵1—2个疗程，能取得较好的防病治病效果。
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